Антон Котяков родился 15 августа 1980 года в Самаре.
В 2002 году окончил Самарскую государственную экономическую академию по специальности "экономическая теория", в 2011 году - магистратуру РАНХиГС при президенте РФ по специальности "административное и финансовое право".
В 2005-2007 годах был начальником отдела в Министерстве управления финансами Самарской области.
С июля 2007 года по апрель 2012 года руководил департаментом исполнения областного бюджета и отчетности Министерства управления финансами Самарской области.
В 2012 году переехал в Москву, где до 2014 года возглавлял управление совершенствования функциональной деятельности Федерального казначейства.
С марта 2014 года по январь 2017 года был министром финансов Московской области.
С 4 мая 2017 года был заместителем министра финансов РФ Антона Силуанова.
Судя по его декларации о доходах (самая свежая — за 2017 год), он не смог заработать ни на квартиру, ни на машину.
У него вообще нет никакого сколько-нибудь дорогого имущества — кроме автостоянки площадью 24 кв. м.
Зато очень состоятельной оказалась его жена: на неё записаны три квартиры площадью 106, 143,9 и 131,8 кв. м, дача площадью 172,8 кв. м, два земельных участка общей площадью 3550 «квадратов», а также три автомобиля: Mercedes-Benz, ВАЗ 2102 и Chevrolet Aveo.
Всё это имущество находится в пользовании у Котякова, указал тот в декларации.
При этом доходы у Котякова в 2017 году были в пять раз больше доходов его жены — 10,4 млн против 2,2 млн рублей.